Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
PPARGC1AQ9UBK2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
PPARGC1AQ9UBK2 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms