Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N7

KLHL13, Kelch-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL13Q9P2N7 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 XRCC1-202ENST00000543982 1994 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
KLHL13Q9P2N7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms