Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPD5

SLCO1B3, Solute carrier organic anion transporter family member 1B3, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1B3Q9NPD5 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 APBB1IP-202ENST00000376236 2771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 NOX5-203ENST00000448182 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SLCO1B3Q9NPD5 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms