Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6J7

C11orf49, UPF0705 protein C11orf49, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf49Q9H6J7 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 RN7SL8P-201ENST00000461771 266 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 CFL1-206ENST00000527344 962 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AC135983.4-201ENST00000564116 1262 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 FAM153B-214ENST00000512862 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
C11orf49Q9H6J7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 MRPL55-214ENST00000366741 603 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 MRPL55-218ENST00000366747 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
C11orf49Q9H6J7 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74 ms