Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TRIM54Q9BYV2 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms