Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SCAPERQ9BY12 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms