Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT4

TDRD1, Tudor domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD1Q9BXT4 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TDRD1Q9BXT4 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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