Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 ECSIT-209ENST00000591104 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
VN1R3Q9BXE9 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms