Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 ADAM11-201ENST00000200557 4571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 PDE5A-202ENST00000354960 7154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC9.47□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 FAM9C-205ENST00000542843 5858 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 CAND2-204ENST00000456430 4573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 ZBTB1-201ENST00000358738 4119 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 LAMB2-201ENST00000305544 5643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.89
RETNLBQ9BQ08 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC9.46□□□□□ -0.9
RETNLBQ9BQ08 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC9.46□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms