Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CCDC7Q96M83 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC7Q96M83 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms