Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C9orf72Q96LT7 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms