Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
NMD3Q96D46 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 PITRM1-206ENST00000451104 3183 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 ISLR-202ENST00000395118 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
NMD3Q96D46 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
NMD3Q96D46 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms