Protein–RNA interactions for Protein: Q92696

RABGGTA, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, humanhuman

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Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTAQ92696 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
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RABGGTAQ92696 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
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RABGGTAQ92696 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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RABGGTAQ92696 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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RABGGTAQ92696 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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RABGGTAQ92696 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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RABGGTAQ92696 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
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RABGGTAQ92696 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGGTAQ92696 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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