Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SMPDL3AQ92484 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms