Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MCOLN3Q8TDD5 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCOLN3Q8TDD5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCOLN3Q8TDD5 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCOLN3Q8TDD5 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCOLN3Q8TDD5 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCOLN3Q8TDD5 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCOLN3Q8TDD5 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MCOLN3Q8TDD5 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCOLN3Q8TDD5 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCOLN3Q8TDD5 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCOLN3Q8TDD5 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCOLN3Q8TDD5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCOLN3Q8TDD5 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCOLN3Q8TDD5 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCOLN3Q8TDD5 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCOLN3Q8TDD5 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCOLN3Q8TDD5 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MCOLN3Q8TDD5 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 159.4 ms