Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
SFRP1Q8N474 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.9 ms