Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 SLC25A38-201ENST00000273158 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 RAPGEF1-202ENST00000372190 6045 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LMNTD2Q8IXW0 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms