Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVD9

NUDCD3, NudC domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUDCD3Q8IVD9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
NUDCD3Q8IVD9 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms