Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 NRDC-201ENST00000352171 3691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 SLC26A1-201ENST00000361661 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 CRMP1-205ENST00000512574 2764 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 RUBCNL-201ENST00000378781 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 PNMA5-205ENST00000535214 3198 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
LINC00299Q6ZSB3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms