Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
SUSD1Q6UWL2 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SUSD1Q6UWL2 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms