Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 TRMT1-203ENST00000437766 2263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
LETMD1Q6P1Q0 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms