Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 NCK1-AS1-203ENST00000474250 827 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 ZNF226-203ENST00000413984 716 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AL031713.1-201ENST00000564813 661 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
FRMPD1Q5SYB0 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 MSI2-204ENST00000442934 1624 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 LINC00470-210ENST00000584090 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 PIGF-202ENST00000306465 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AL512430.1-201ENST00000392575 860 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 KRT8P21-201ENST00000430398 1491 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
FRMPD1Q5SYB0 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms