Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 HAUS2-207ENST00000568846 709 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CDCA8Q53HL2 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CDCA8Q53HL2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms