Protein–RNA interactions for Protein: Q53H82

LACTB2, Endoribonuclease LACTB2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LACTB2Q53H82 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LACTB2Q53H82 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LACTB2Q53H82 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms