Protein–RNA interactions for Protein: Q53FZ2

ACSM3, Acyl-coenzyme A synthetase ACSM3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACSM3Q53FZ2 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
ACSM3Q53FZ2 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms