Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZG55

GREB1, Protein GREB1, humanhuman

Predictions only

Length 1,949 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GREB1Q4ZG55 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GREB1Q4ZG55 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms