Protein–RNA interactions for Protein: Q2M329

CCDC96, Coiled-coil domain-containing protein 96, humanhuman

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Length 555 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC96Q2M329 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 ATG10-202ENST00000355178 1438 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
CCDC96Q2M329 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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