Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 THSD4-202ENST00000355327 9200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 OPA1-202ENST00000361510 6492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ACAN-209ENST00000617301 8669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 CSPG4P12-202ENST00000559989 7790 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
RTL8BQ17RB0 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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