Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 PDCD6-202ENST00000505221 672 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
ZNF239Q16600 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 STK4-AS1-201ENST00000434401 2065 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
ZNF239Q16600 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.2□□□□□ -0.14
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