Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AC097724.1-201ENST00000609581 426 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NCOA1Q15788 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
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