Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 976 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 C12orf49-201ENST00000261318 8404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SYCP1Q15431 STRA6-218ENST00000574278 2455 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms