Protein–RNA interactions for Protein: Q15054

POLD3, DNA polymerase delta subunit 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD3Q15054 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
POLD3Q15054 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms