Protein–RNA interactions for Protein: Q14995

NR1D2, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 2, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1D2Q14995 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 UBAP1-201ENST00000297661 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 CYB561D1-204ENST00000420578 3326 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
NR1D2Q14995 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms