Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AL139008.1-201ENST00000437894 228 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
SPTAN1Q13813 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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