Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
APOFQ13790 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 AC021683.3-202ENST00000592572 4440 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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APOFQ13790 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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APOFQ13790 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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APOFQ13790 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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APOFQ13790 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
APOFQ13790 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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APOFQ13790 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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APOFQ13790 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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APOFQ13790 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
APOFQ13790 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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