Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SKP2Q13309 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms