Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
NPRL3Q12980 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPRL3Q12980 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPRL3Q12980 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPRL3Q12980 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPRL3Q12980 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPRL3Q12980 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPRL3Q12980 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPRL3Q12980 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPRL3Q12980 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPRL3Q12980 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPRL3Q12980 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
NPRL3Q12980 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPRL3Q12980 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPRL3Q12980 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPRL3Q12980 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPRL3Q12980 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPRL3Q12980 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPRL3Q12980 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPRL3Q12980 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPRL3Q12980 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPRL3Q12980 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPRL3Q12980 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPRL3Q12980 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPRL3Q12980 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPRL3Q12980 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPRL3Q12980 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
NPRL3Q12980 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms