Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 ZNF138-201ENST00000307355 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 RPL13AP25-201ENST00000484130 612 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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LMAN2Q12907 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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LMAN2Q12907 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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LMAN2Q12907 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
LMAN2Q12907 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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