Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
APOBRQ0VD83 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms