Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NIPAL4Q0D2K0 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms