Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 DHPS-201ENST00000210060 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SOX4Q06945 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 IQCF3-202ENST00000440739 505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SOX4Q06945 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms