Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
GBE1Q04446 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GBE1Q04446 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms