Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 ITSN1-205ENST00000381291 5437 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
UBXN1Q04323 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms