Protein–RNA interactions for Protein: Q04206

RELA, Transcription factor p65, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RELAQ04206 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 PPP1R26P4-201ENST00000619065 3527 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RELAQ04206 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RELAQ04206 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RELAQ04206 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RELAQ04206 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RELAQ04206 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RELAQ04206 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RELAQ04206 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
RELAQ04206 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RELAQ04206 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RELAQ04206 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RELAQ04206 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RELAQ04206 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
RELAQ04206 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
RELAQ04206 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
RELAQ04206 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RELAQ04206 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RELAQ04206 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RELAQ04206 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RELAQ04206 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RELAQ04206 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RELAQ04206 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
RELAQ04206 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RELAQ04206 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
RELAQ04206 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms