Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MDM2Q00987 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MDM2Q00987 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms