Protein–RNA interactions for Protein: P81133

SIM1, Single-minded homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIM1P81133 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AC104596.1-201ENST00000507826 579 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SIM1P81133 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SIM1P81133 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SIM1P81133 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms