Protein–RNA interactions for Protein: P78364

PHC1, Polyhomeotic-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHC1P78364 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC1P78364 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC1P78364 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC1P78364 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC1P78364 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC1P78364 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PHC1P78364 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHC1P78364 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHC1P78364 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHC1P78364 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHC1P78364 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHC1P78364 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHC1P78364 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHC1P78364 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHC1P78364 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PHC1P78364 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PHC1P78364 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PHC1P78364 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
PHC1P78364 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms