Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 SPIRE1-201ENST00000309836 1877 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ABCE1P61221 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms