Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 IDO2-204ENST00000502986 2294 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 METTL16-201ENST00000263092 5711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 TAOK2-201ENST00000279394 4246 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 UTY-203ENST00000362096 4990 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 USP31-201ENST00000219689 10699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 MKX-201ENST00000375790 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 TCF4-276ENST00000635822 7805 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 GOLGA6L2-202ENST00000345070 1972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 PCNX4-202ENST00000391611 4073 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 VMP1-201ENST00000262291 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 C17orf53-202ENST00000319977 2725 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 ATG5-202ENST00000360666 2712 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 LILRB3-203ENST00000391750 2848 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 KCND3-203ENST00000369697 7396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 CELF3-202ENST00000290585 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 AHI1-205ENST00000457866 5549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 KDM2B-215ENST00000542973 3170 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 LRTM2-208ENST00000543818 3986 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 TACC1-201ENST00000276520 6513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 SLC35B4-201ENST00000378509 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.2□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 TCF3-202ENST00000344749 4289 ntTSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 RBP3-201ENST00000584701 4276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 VAMP1-201ENST00000361716 3449 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 BOD1L1-201ENST00000040738 10565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 POM121L6P-201ENST00000441186 1826 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 PDZRN3-208ENST00000479530 2778 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 ZBTB44-202ENST00000397753 3951 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 LARGE1-203ENST00000402320 3955 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 CADM3-AS1-201ENST00000415675 5044 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 FAM200B-223ENST00000622362 4377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 CACNA1C-213ENST00000399629 6562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 SLC27A6-203ENST00000506176 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 YLPM1-201ENST00000325680 7108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 MYH4-201ENST00000255381 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 SLC26A4-201ENST00000265715 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 LDHAL6A-201ENST00000280706 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 ZNF25-201ENST00000302609 4139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 MIEF1-201ENST00000325301 5625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 MTHFR-204ENST00000376590 7094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 ABCC5-202ENST00000334444 5921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC9.19□□□□□ -0.94
TMEM258P61165 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.19□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms