Protein–RNA interactions for Protein: P58512

LINC01547, Uncharacterized protein encoded by LINC01547, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01547P58512 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 INTS1-201ENST00000404767 6959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 RSPH9-201ENST00000372163 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 GPRASP1-203ENST00000444152 5809 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 NRP2-201ENST00000272849 5909 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 GPAT3-201ENST00000264409 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CCDC88A-204ENST00000413716 9586 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 IKZF1-218ENST00000615491 5637 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 HIPK3-202ENST00000379016 7345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 BRWD1-201ENST00000333229 10141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 SAMD4A-202ENST00000392067 6833 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
LINC01547P58512 CA12-201ENST00000178638 6413 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms